儿童身高矮小可以根据具体情况选择儿童保健科、内分泌科、骨科、遗传代谢科等科室，针对具体原因进行相应的诊疗。
1、儿童保健科：如果孩子身高矮小的情况不太明显，且没有其他明显的异常症状，可先挂儿童保健科，医生会进行生长发育评估、营养状况分析等，这种情况通常较为常见，问题相对较轻，但若评估发现严重的发育迟缓，就需要进一步检查。
2、内分泌科：当怀疑孩子身高矮小是由于内分泌系统疾病引起，如生长激素缺乏、甲状腺功能减退等，应挂内分泌科，内分泌疾病若不及时诊治，可能会影响孩子的终身身高，后果较为严重。
3、骨科：如果孩子存在骨骼发育异常，如骨龄落后、骨骼畸形等，骨科是一个选择，轻度的骨骼发育问题可能通过矫正和治疗得到改善，但严重的骨骼畸形可能导致身体残疾，影响更为严重。
4、遗传代谢科：对于有家族性矮小病史或怀疑存在遗传代谢性疾病导致身高问题的孩子，遗传代谢科是合适的科室，某些遗传代谢疾病不仅影响身高，还可能累及多个器官系统，这种情况较为复杂和严重。
5、神经内科：如果孩子的身高矮小与神经系统疾病相关，如脑垂体肿瘤压迫神经影响生长激素分泌等，需要挂神经内科，神经系统疾病往往病情较为隐匿，一旦确诊治疗难度较大，对孩子的健康威胁也更大。
儿童身高矮小是一个需要专业医疗干预的问题，家长应保持冷静，及时带孩子就医，并在医生的指导下进行针对性的检查和治疗，通过科学的诊疗措施，为孩子的健康成长提供有力保障。